Badania prowadzone w Katedrze Fizjologii Klinicznej koncentrują się przede wszystkim na analizie kodowania chemicznego neuronów enterycznego układu nerwowego, jak również poszukiwaniu źródeł unerwienia narządów wewnętrznych świni. W doświadczeniach stosowane są techniki immunohistochemiczne oraz immunofluorescencyjne. Dodatkowo w Katedrze wykorzystywane są metody wstecznego znakowania neuronów z wykorzystaniem znacznika Fast Blue. Stosowana metoda pozwala identyfikować neurony zaopatrujące badany narząd, a następnie umożliwia poznanie substancji biologicznie aktywnych syntetyzowanych przez badany neuron i wykorzystywanych przez ten neuron do regulacji funkcji zaopatrywanego przez niego narządu. Warsztat naukowy Katedry obejmuje również eksperymentalne wywoływanie stanów patologicznych oraz badanie zmienności adaptacyjnej (kodowania chemicznego) komórek układu nerwowego w odpowiedzi na wybrane substancje oraz bodźce patologiczne.
W chwili obecnej badania prowadzone w Katedrze dotyczą głównie: